实验室配备了先进专业的仪器设备，如超景三维显微系统、台式扫描电镜、微生物鉴定及药敏分析系统、两级微生物发酵系统、流式细胞仪、蛋白质纯化仪、土壤重金属分析仪、ICP-MS质谱仪、制备液相色谱仪、高效液相色谱仪、气相-质谱联用仪、X-射线粉末衍射仪、原子吸收分光光度计、傅立叶红外变换光谱仪等3000余万元科研仪器设备，其中万元以上仪器60多台套，大型仪器设备已加入广西大型仪器设备共享平台。
